在上述兼有殖民情結及宣教熱誠的歷史處境下,出身蘇格蘭的馬雅各醫師(JamesLaidlawMaxwell, 1836-1921)於1865年受英國長老教會(PresbyterianChurch ofEngland)差派抵達南台灣展開以「醫療宣教」為主軸的宣教工作,成為接續廈門(1849)、汕頭(1858)之後的第三個宣教區。緊接著,屬於加拿大第二代蘇格蘭裔移民的偕叡理牧師(GeorgeLeslie Mackay,1844-1901,通稱馬偕)也於1872年受加拿大長老教會(PresbyterianChurch ofCanada)差派,在北台灣的淡水展開宣教工作。同樣和蘇格蘭教會擁有深厚淵源的英國和加拿大兩個長老教會先後在台灣南部及北部投入宣教工作,意義深遠,這也對後來台灣教會的合一運動以及長老教會總會的成立有關鍵性的影響。整體而言,台灣宣教的草創階段可以說是在福音和本地文化的對立衝突中努力地以「現世化的語言」(secularizedlanguage)——亦即醫療、教育、文字、社會服務等工作——來實際關懷人的需要,並消除台灣大眾對基督教的敵意和偏見。